Сколько сайтов рестрикции могла бы иметь рестриктаза HaeIII в плазмиде, содержащей 4000 пар оснований

Тема: Рестрикция рестриктазой HaeIII в плазмиде

Пояснение: Рестрикция - это процесс разрезания молекулы ДНК рестриктазой на определенные узнаваемые последовательности, называемые сайтами рестрикции. Рестриктаза HaeIII распознает и разрезает последовательность 5"-GGCC-3".

Для решения данной задачи, нам необходимо узнать, сколько раз последовательность 5"-GGCC-3" может повторяться в плазмиде.

Учитывая, что плазмида содержит 4000 пар оснований, случайное распределение нуклеотидов и равное количество A, T, C и G, мы можем рассчитать количество сайтов рестрикции следующим образом:

1. Расчитаем вероятность, что каждая пара оснований будет иметь последовательность 5"-GGCC-3". Вероятность того, что каждая пара будет составлена из последовательности GG, составляет (1/4)^2 = 1/16. Аналогично, вероятность каждой пары будет иметь последовательность CC равна (1/4)^2 = 1/16.
2. Так как GG и CC могут встречаться в любом порядке, мы должны умножить вероятности обнаружения GG и CC, что дает (1/16) * (1/16) = 1/256.
3. Чтобы найти общее количество сайтов рестрикции, мы делим общее число пар оснований на число пар оснований на сайте рестрикции. В нашем случае, 4000 разделить на 256, равно 15.625 пары оснований.
4. Поскольку сайт рестрикции HaeIII состоит из 4 нуклеотидов, получаем 3.90625 сайтов рестрикции.

Например: В плазмиде, содержащей 4000 пар оснований с равным количеством A, T, C и G, найдите число предполагаемых сайтов рестрикции для рестриктазы HaeIII.

Совет: Для более простого понимания материала, рекомендуется ознакомиться с понятиями рестрикции ДНК, сайтов рестрикции и свойствами рестриктазы HaeIII. Также ознакомьтесь с основами вероятности, чтобы понять, как рассчитывается вероятность обнаружения определенной последовательности ДНК.

Практика: В плазмиде, содержащей 8000 пар оснований, найдите число предполагаемых сайтов рестрикции для рестриктазы HaeIII. Введите численный ответ.